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Atmore, Lane M. and Ferrari, Giada and Martínez-García, Lourdes and van der Jagt, Inge and Blevis, Rachel and Granado, José and Häberle, Simone and Dierickx, Katrien and Quinlan, Liz M. and Lõugas, Lembi and Makowiecki, Daniel and Hufthammer, Anne Karin and Barrett, James H. and Star, Bastiaan. (2023) Ancient DNA sequence quality is independent of fish bone weight. Journal of archaeological science, 149. p. 105703.

Häberle, Simone. (2022) Kleinsäuger und Fische. In: Der Abri Unterkobel bei Oberriet: ein interdisziplinärer Blick auf 8000 Jahre Siedlungs- und Umweltgeschichte im Alpenrheintal. St. Gallen, pp. 253-277.

Wegmüller, Fabio and Affolter, Jehanne and Akeret, Örni and Bailon, Salvador and Brönnimann, David and Colonese, André C. and Craig, Oliver E. and Häberle, Simone and Hajidas, Irka and Oberhänsli, Monika and Robson, Harry K. and Schibler, Jörg and Schindler, Martin P. and Schlumbaum, Angela and Stopp, Barbara and Thew, Nigel and Wojtczak, Dorota. (2022) Synthese. In: Der Abri Unterkobel bei Oberriet. Ein interdisziplinärer Blick auf 8000 Jahre Siedlungs- und Umweltgeschichte im Alpenrheintal, 3. St. Gallen, pp. 357-386.

Antolín, Ferran and Martínez-Grau, Hector. and Steiner, Bigna and Follmann, Francis and Soteras, Raül and Häberle, Simone and Prats, Georgina and Schäfer, Marguerita and Mainberger, Martin and Hajdas, Irka and Banchieri, Daria G.. (2022) Neolithic occupations (c. 5200-3400 cal BC) at Isolino Virginia (Lake Varese, Italy) and the onset of the pile-dwelling phenomenon around the Alps. Journal of Archaeological Science: Reports, 42. p. 103375.

Häberle, Simone and Vandorpe, Patricia and Akeret, Örni and Wick, Lucia. (2022) Weitere archäobiologische Untersuchungen. In: Baubefunde im Nordquartier des Vicus. Ein Blick in die Hinterhöfe. Zürrich, pp. 188-193.

Häberle, Simone and Vandorpe, Patricia and Akeret, Örni and Burckhardt, Livia and Deschler-Erb, Sabine and Hüster Plogmann, Heidemarie. (2022) Archäobiologische Untersuchungen der Latrinen. In: Baubefunde im Nordquartier des Vicus. Ein Blick in die Hinterhöfe. Zürich, pp. 148-155.

Akeret, Örni and Deschler-Erb, Sabine and Häberle, Simone and Jagher, Reto and Rentzel, Philippe and Wick, Lucia. (2022) Geschichte der Umwelt und der Nutzung von Pflanzen und Tieren am Rhein(knie). In: Ave Caesar! Römer, Gallier und Germanen am Rhein. Basel, pp. 83-95.

Häberle, Simone and Schafer, Marguerita and Soteras, Raul and Martinez-Grau, Hector and Hajdas, Irka and Jacomet, Stefanie and Röder, Brigitte and Schibler, Jörg and van Willigen, Samuel and Antolin, Ferran. (2022) Small Animals, Big Impact? Early Farmers and Pre- and Post-Harvest Pests from the Middle Neolithic Site of Les Bagnoles in the South-East of France (L'Isle-sur-la-Sorgue, Vaucluse, Provence-Alpes-Cote-d'Azur). Animals, 12 (12). ARTN 1511.

Ramstein, Marianne and Steuri, Noah and Brönnimann, David and Rentzel, Philippe and Cornelissen, Marcel and Schimmelpfennig, Dirk and Anselmetti, Flavio S. and Häberle, Simone and Vandorpe, Patricia and Siebke, Inga and Furtwängler, Anja and Szidat, Sönke and Hafner, Albert and Krause, Johannes and Lösch, Sandra. (2022) The well-preserved Late Neolithic dolmen burial of Oberbipp, Switzerland. Construction, use, and post-depositional processes. Journal of Archaeological Science: Reports, 42. p. 103397.

Häberle, Simone. (2022) Die Kleintierreste aus der spätlatènezeitlichen Befestigungsanlage. In: Zu Gast bei Offizieren in Vindonissa - von der spätlatènezeitlichen Befestigung zur Grossküche eines Offiziersgebäudes. Basel, pp. 379-381.

Häberle, Simone. (2022) Den Legionären und Offizieren in den Kochtopf geschaut: Untersuchung der tierischen Schlämmreste aus Strukturen der Steinbauperioden SP1, SP2 und SP3 der Grabung Windisch-Römerblick 2002-2004 (V.002.11) in Vindonissa. In: Zu Gast bei Offizieren in Vindonissa - von der spätlatènezeitlichen Befestigung zur Grossküche eines Offiziersgebäudes. Basel, pp. 381-398.

Häberle, Simone and Vandorpe, Patricia and Brombacher, Christoph and Hüster Plogmann, Heide. (2022) Archäobiologische Untersuchung der Brunnen und Wassersammler. In: Baubefunde im Nordquartier des Vicus. Ein Blick in die Hinterhöfe, Band 1: Synthese. Zürich/Egg, pp. 131-134.

Häberle, Simone. (2022) Archäozoologische Untersuchung der Schlämmreste der Ausgrabungen in Aeschi SO, Burgäschisee-Nord und Seeberg BE, Burgäschisee-Südwest (2015-2016). In: Burgäschisee 5000-3000 v. Chr.: Siedlungsdynamik und Mobilität, Landnutzung und Subsistenz. Leiden, pp. 293-310.

Häberle, Sabine and Deschler-Erb, Sabine and Hüster Plogmann, Heide and Stopp, Barbara and Lo Russo, Sarah and Koch, Pirmin and Ackermann, Regula. (2021) Animals in ritual and domestic context: A comparative study between the faunal assemblages from residential areas and two sanctuaries at the vicus of Kempraten (Rapperswil-Jona, CH). In: Roman Animals in Ritual and Funerary Contexts. Proceedings of the 2nd Meeting of the Zooarchaeology of the Roman Period Working Group, Basel 1st-4th February, 2018. Kolloquien zur Vor- und Frühgeschichte. Wiesbaden, pp. 79-99.

Häberle, Simone and Deschler-Erb, Sabine and Hüster Plogmann, Heide and Stopp, Barbara and Lo Russo, Sarah and Koch, Pirmin and Ackermann, Regula. (2021) Animals in ritual and domestic context: A comparative study between the faunal assemblages from residential areas and two sanctuaries at the vicus of Kempraten (Rapperswil-Jona, CH). In: Roman Animals in Ritual and Funerary Contexts. Proceedings of the 2nd Meeting of the Zooarchaeology of the Roman Period Working Group, Basel 1st-4th February, 2018.. Wiesbaden, pp. 79-99.

Ackermann, Regula and Akeret, Örni and Deschler-Erb, Sabine and Häberle, Simone and Lo Russo, Sarah and Peter, Markus and Pümpin, Christine and Schlumbaum, Angela. (2020) Spotlighting leftovers. The mithraeum at Kempraten (Rapperswil-Jona, Switzerland). An interdisciplinary analysis project and its initial results. In: The Archaeology of Mithraism. New Finds and Approaches to Mithras-Worship. Leuven - Paris - Bristol, CT, pp. 47-63.

Hafner, Albert and Rey, Fabian and Hostettler, Marco and Laabs, Julian and Bolliger, Matthias and Brombacher, Christoph and Francuz, John and Gobet, Erika and Häberle, Simone and Rentzel, Philippe and Schäfer, Marguerita and Schibler, Jörg and Wey, Othmar and Tinner, Willy. (2020) Archaeological and palaeoecological investigations at Burgäschisee (Swiss Plateau): new interdisciplinary insights in Neolithic settlement, land use and vegetation dynamics. In: Settling Waterscapes in Europe. The Archaeology of Neolithic and Bronze Age Pile-Dwellings. Heidelberg, pp. 173-204.

Häberle, Simone and Ginella, Francesca and Stopp, Barbara. (2020) Archäozoologische Reste aus dem Dolmen. In: Jahrbuch des Archäologischen Dienstes des Kantons Bern, 2020. Bern, pp. 170-178.

Häberle, Simone and Hüster Plogmann, Heide. (2019) Fish exploitation in medieval and early modern Switzerland: evidence from the ichthyoarchaeological record and historical sources. International Journal of Osteoarchaeology, 29 (3). pp. 420-431.

Häberle, Simone. (2019) 16.1 Feinkost unterm Fussboden: Untersuchung der archäozoologischen Schlämmreste aus Raum F von Anlage 2b. In: Tomils, Sogn Murezi. Ein kirchliches Zentrum im frühmittelalterlichen Graubünden, 3. Graubünden, pp. 425-442.

Häberle, Simone. (2019) Die Nutzung von Amphibien und Reptilien durch den steinzeitlichen Menschen. Festschrift 40 Jahre KARCH: Wie es zur Gründung der Koordinationsstelle für Amphibien- und Reptilienschutz in der Schweiz (KARCH) kam, info fauna - Centre Suisse de Cartographie de la Faune (CSCF) . pp. 5-6. Neuchâtel.

Antolín, Ferran and Häberle, Simone and Jesus, Ana and Martínez-Grau, Hector and Prats, Georgina and Schäfer, Marguerita and Steiner, Bigna. (2018) The AgriChange Project: an integrated on-site approach to agricultural and land-use change in relation to climate during the Neolithic in Western Europe. Past Global Changes Magazine, 26 (1). pp. 26-27.

Bleicher, Niels and Antolín, Ferran and Heiri, Oliver and Häberle, Simone and Hüster-Plogmann, Heide and Jacomet, Stefanie and Pümpin, Christine and Rentzel, Philippe and Schäfer, Marguerita and Schibler, Jörg and Wiemann, Philipp and van Hardenbroek, Maarten and Toth, Monika and Zweifel, Noëmi. (2018) Middens, currents and shorelines: complex depositional processes of waterlogged prehistoric lakeside settlements based on the example of Zurich-Parkhaus Opéra (Switzerland). Journal of Archaeological Science, 97. pp. 26-41.

Kühn, Marlu and Deschler-Erb, Sabine and Häberle, Simone. (2018) Landwirtschaft und Umwelt im Spiegel archäobiologischer Funde - Materialvorlage. In: Die Schweiz von 1350 bis 1850 im Spiegel archäologischer Quellen. Akten des Kolloquiums Bern 25.-26.1.2018. Basel, pp. 489-501.

Marti-Grädel, Elisabeth and Häberle, Simone and Akeret, Örni. (2018) Archäozoologie und Archäobotanik. Mitteilungen der Naturforschenden Gesellschaft in Bern. Neue Folge, 75. pp. 76-99.

Deschler-Erb, Sabine and Alterauge, Amelie and Camenisch, Chantal and Cooper, Christine and Descoeudres, Georges and Granado, José and Haeberle, Simone and Hotz, Gerhard and Lösch, Sandra and Kühn, Marlu and Rohr, Christian and Wick, Lucia. (2018) Kapitel 3: Mensch und Umwelt. In: Die Schweiz von 1350 bis 1850 im Spiegel archäologischer Quellen : Akten des Kolloquiums, Bern, 25.-26.1.2018. Basel, pp. 61-98.

Hüster Plogmann, Heide and Häberle, Simone. (2017) Archäozoologische Schlämmreste aus den Schichten 13 und 14. In: Zürich-Parkhaus Opéra. Eine neolithische Feuchtbodenfundstelle, Band 3: Naturwissenschaftliche Analysen und Synthese, 3. Zürich, pp. 127-144.

Granado Alonso, José David and Häberle, Simone and Hüster PLogmann, Heide and Schibler, Jörg and Schlumbaum, Angela. (2017) Millennia-Long Co-Existence of Two Major European Whitefish (Coregonus spp.) Lineages in Switzerland Inferred from Ancient Mitochondrial DNA. Diversity, 9 (3). p. 34.

Deschler-Erb, Sabine and Akeret, Örni and Häberle, Simone. (2017) Gemeinsam stark - Der archäobiologische Feldkurs in Xanten 2016. Kölner und Bonner Archaeologica. pp. 139-141.

Bleicher, Niels and Harb, Christian and Antolín, Ferran and Häberle, Simone and Hüster Plogmann, Heide and Jacomet, Stefanie and Schäfer, Marguerita and Schibler, Jörg. (2017) Wirtschaft. In: Zürich-Parkhaus Opéra: eine neolithische Feuchtbodenfundstelle, Band 3: Naturwissenschaftliche Analysen und Synthese. Dübendorf, pp. 231-238.

Bleicher, Niels and Antolin, Ferran and Gobet, Erika and Jacomet, Stefanie and Tinner, Willy and Hüster Plogmann, Heide and Häberle, Simone. (2017) Umwelt-, Landschaft- und Besiedlungsgeschichte. In: Zürich-Parkhaus Opéra: eine neolithische Feuchtbodenfundstelle, Band 3: Naturwissenschaftliche Analysen und Synthese. Dübendorf, pp. 226-231.

Bleicher, Niels and Antolin, Ferran and Heiri, Oliver and Hüster Plogmann, Heide and Jacomet, Stefanie and Pümpin, Christine and Rentzel, Philippe and Schäfer, Marguerita and Schibler, Jörg and Wiemann, Philipp. (2017) Taphonomie und Schichtgenese. In: Zürich-Parkhaus Opéra: eine neolithische Feuchtbodenfundstelle, Band 3: Naturwissenschaftliche Analysen und Synthese. Dübendorf, pp. 215-226.

Häberle, Simone and Fuller, Benjamin T. and Nehlich, Olaf and Van Neer, Wim and Schibler, Jörg and Hüster Plogmann, Heide. (2016) Inter- and intraspecies variability in stable isotope ratio values of archaeological freshwater fish remains from Switzerland(11th–19th centuries AD). Environmental archaeology, 21 (2). pp. 119-132.

Häberle, Simone and Nehlich, Olaf and Fuller, Benjamin and Schibler, Jörg and Van Neer, Wim and Hüster Plogmann, Heide. (2016) Carbon and nitrogen isotopic ratios in archaeological and modern Swiss fish as possible markers for diachronic anthropogenic activity in freshwater ecosystems. Journal of Archaeological Science: Reports, 10. pp. 411-423.

Häberle, Simone and Schibler, Jörg and Van Neer, Wim and Hüster Plogmann, Heide. (2015) Fischknochen als Indikatoren für Gewässerzustand und menschliche Fischselektion. Eine zusammenfassende Auswertung mittelalterlicher und neuzeitlicher Fischreste aus dem Rheineinzugsgebiet der Schweiz. Archäologisches Korrespondenzblatt, 45 (3). pp. 417-437.

Häberle, Simone. (2015) Von Fischen und Fischern. Jahresbericht der Archäologischen Bodenforschung des Kantons Basel-Stadt, 2014. pp. 72-107.

Häberle, Simone. Auswertung von mittelalterlichen und neuzeitlichen Fischresten unter Anwendung eines kombinierten methodischen Ansatzes. Ein Beitrag zur Erforschung des menschlichen Umgangs mit aquatischen Ökosystemen im Schweizer Rheineinzugsgebiet. 2015, Doctoral Thesis, University of Basel, Faculty of Science.

Simone Häberle, . (2013) Fischknochen als Bioindikatoren aus dem Mittelalter.

Simone Häberle, . (2013) Archäozoologie. In: Meienberg - eine mittelalterliche Stadtwüstung im oberen Freiamt. Baden, pp. 86-105.

Simone Häberle, . (2013) Auswertung der archäozoologischen Schlämmreste aus der Grube HB6.II_GR5. In: Der römische Vicus von Kempraten, Rapperswil-Jona : Neubetrachtung anhand der Ausgrabungen Fluhstrasse 6-10 (2005-2006). St.Gallen, pp. 190-196.

Vandorpe, Patricia. (2013) Archäobotanische Untersuchung an den Gruben HB5.I_GR4 und HB6.II_GR5. In: Der römische Vicus von Kempraten, Rapperswil-Jona : Neubetrachtung anhand der Ausgrabungen Fluhstrasse 6-10 (2005-2006). St.Gallen, pp. 184-189.

Häberle, Simone and Matt, Christoph Ph. and Vandorpe, Patricia and Akeret, Örni. (2010) Esskultur im Hinterhof : interdisziplinäre Auswertung einer mittelalterlichen Latrine, Grabung 2002/15, Schnabelgasse 6, Basel. In: Jahresbericht der Archäologischen Bodenforschung des Kantons Basel-Stadt, 2008. Basel, pp. 79-145.

Häberle, Simone and Betschart, Madeleine. (2010) Fisch: wichtige Nahrungsquelle im Mittelalter. In: Bieler Jahrbuch = Annales biennoises 2009. Biel, pp. 233-240.

Häberle, Simone. (2009) Lachs – lebendiges Kulturgut aus dem Rhein. Nike Bulletin, 4. pp. 34-39.

Häberle, Simone and Betschart, Madeleine. (2009) Fisch – Ressource aus dem Wasser. Archäologie Schweiz, 32 (3). pp. 36-39.

Häberle, Simone. (2009) Archaeoichthyology and museum. An exhibition about fish and fishing in the past. In: Fishes - Culture - Environment through Archaeoichthyology, Ethnography & History. Poznan, pp. 201-206.

Häberle, Simone and Marti-Grädel, Elisabeth. (2006) Die Teichwirtschaft vom Mittelalter bis in die Frühe Neuzeit. In: Fisch und Fischer aus zwei Jahrtausenden : eine fischereiwirtschaftliche Zeitreise durch die Nordwestschweiz. Augst, pp. 149-159.