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Antolín, Ferran and Häberle, Simone and Jesus, Ana and Martínez-Grau, Hector and Prats, Georgina and Schäfer, Marguerita and Steiner, Bigna. (2018) The AgriChange Project: an integrated on-site approach to agricultural and land-use change in relation to climate during the Neolithic in Western Europe. Past Global Changes Magazine, 26 (1). pp. 26-27.

Häberle, Simone. (2015) Von Fischen und Fischern. Jahresbericht der Archäologischen Bodenforschung des Kantons Basel-Stadt, 2014. pp. 72-107.

Simone Häberle, . (2013) Fischknochen als Bioindikatoren aus dem Mittelalter.

Simone Häberle, . (2013) Archäozoologie. In: Meienberg - eine mittelalterliche Stadtwüstung im oberen Freiamt. Baden, pp. 86-105.

Simone Häberle, . (2013) Auswertung der archäozoologischen Schlämmreste aus der Grube HB6.II_GR5. In: Der römische Vicus von Kempraten, Rapperswil-Jona : Neubetrachtung anhand der Ausgrabungen Fluhstrasse 6-10 (2005-2006). St.Gallen, pp. 190-196.

Vandorpe, Patricia. (2013) Archäobotanische Untersuchung an den Gruben HB5.I_GR4 und HB6.II_GR5. In: Der römische Vicus von Kempraten, Rapperswil-Jona : Neubetrachtung anhand der Ausgrabungen Fluhstrasse 6-10 (2005-2006). St.Gallen, pp. 184-189.

Häberle, Simone and Matt, Christoph Ph. and Vandorpe, Patricia and Akeret, Örni. (2010) Esskultur im Hinterhof : interdisziplinäre Auswertung einer mittelalterlichen Latrine, Grabung 2002/15, Schnabelgasse 6, Basel. In: Jahresbericht der Archäologischen Bodenforschung des Kantons Basel-Stadt, 2008. Basel, pp. 79-145.

Häberle, Simone and Betschart, Madeleine. (2010) Fisch: wichtige Nahrungsquelle im Mittelalter. In: Bieler Jahrbuch = Annales biennoises 2009. Biel, pp. 233-240.

Häberle, Simone and Betschart, Madeleine. (2009) Fisch – Ressource aus dem Wasser. Archäologie Schweiz, 32 (3). pp. 36-39.

Häberle, Simone and Marti-Grädel, Elisabeth. (2006) Die Teichwirtschaft vom Mittelalter bis in die Frühe Neuzeit. In: Fisch und Fischer aus zwei Jahrtausenden : eine fischereiwirtschaftliche Zeitreise durch die Nordwestschweiz. Augst, pp. 149-159.

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Häberle, Simone and Hüster Plogmann, Heide. (2019) Fish exploitation in medieval and early modern Switzerland: evidence from the ichthyoarchaeological record and historical sources. International Journal of Osteoarchaeology, 29 (3). pp. 420-431.

Bleicher, Niels and Antolín, Ferran and Heiri, Oliver and Häberle, Simone and Hüster-Plogmann, Heide and Jacomet, Stefanie and Pümpin, Christine and Rentzel, Philippe and Schäfer, Marguerita and Schibler, Jörg and Wiemann, Philipp and van Hardenbroek, Maarten and Toth, Monika and Zweifel, Noëmi. (2018) Middens, currents and shorelines: complex depositional processes of waterlogged prehistoric lakeside settlements based on the example of Zurich-Parkhaus Opéra (Switzerland). Journal of Archaeological Science, 97. pp. 26-41.

Kühn, Marlu and Deschler-Erb, Sabine and Häberle, Simone. (2018) Landwirtschaft und Umwelt im Spiegel archäobiologischer Funde - Materialvorlage. In: Die Schweiz von 1350 bis 1850 im Spiegel archäologischer Quellen. Akten des Kolloquiums Bern 25.-26.1.2018. Basel, pp. 489-501.

Marti-Grädel, Elisabeth and Häberle, Simone and Akeret, Örni. (2018) Archäozoologie und Archäobotanik. Mitteilungen der Naturforschenden Gesellschaft in Bern. Neue Folge, 75. pp. 76-99.

Hüster Plogmann, Heide and Häberle, Simone. (2017) Archäozoologische Schlämmreste aus den Schichten 13 und 14. In: Zürich-Parkhaus Opéra. Eine neolithische Feuchtbodenfundstelle, Band 3: Naturwissenschaftliche Analysen und Synthese, 3. Zürich, pp. 127-144.

Granado Alonso, José David and Häberle, Simone and Hüster PLogmann, Heide and Schibler, Jörg and Schlumbaum, Angela. (2017) Millennia-Long Co-Existence of Two Major European Whitefish (Coregonus spp.) Lineages in Switzerland Inferred from Ancient Mitochondrial DNA. Diversity, 9 (3). p. 34.

Deschler-Erb, Sabine and Akeret, Örni and Häberle, Simone. (2017) Gemeinsam stark - Der archäobiologische Feldkurs in Xanten 2016. Kölner und Bonner Archaeologica. pp. 139-141.

Häberle, Simone and Fuller, Benjamin T. and Nehlich, Olaf and Van Neer, Wim and Schibler, Jörg and Hüster Plogmann, Heide. (2016) Inter- and intraspecies variability in stable isotope ratio values of archaeological freshwater fish remains from Switzerland(11th–19th centuries AD). Environmental archaeology, 21 (2). pp. 119-132.

Häberle, Simone and Nehlich, Olaf and Fuller, Benjamin and Schibler, Jörg and Van Neer, Wim and Hüster Plogmann, Heide. (2016) Carbon and nitrogen isotopic ratios in archaeological and modern Swiss fish as possible markers for diachronic anthropogenic activity in freshwater ecosystems. Journal of Archaeological Science: Reports, 10. pp. 411-423.

Häberle, Simone and Schibler, Jörg and Van Neer, Wim and Hüster Plogmann, Heide. (2015) Fischknochen als Indikatoren für Gewässerzustand und menschliche Fischselektion. Eine zusammenfassende Auswertung mittelalterlicher und neuzeitlicher Fischreste aus dem Rheineinzugsgebiet der Schweiz. Archäologisches Korrespondenzblatt, 45 (3). pp. 417-437.